하지만 공개되자마자 건국절 등 이슈가 되었던 부분들에 대한 논란을 넘어 단순한 사실에 대한 기술조차 오류가 많아 교과서가 얼마나 졸속으로 만들어졌는지 입증되고 있다. 4괘가 잘못 표시된 태극기가 버젓이 실려 실소를 금치 못하고 있다. 얼마나 부주의했으면 태극기가 잘못되었다는 것을 발견하지 못했을까. 이 뿐만 아니라 누구나 다 아는 기본적인 사실조차도 잘못 기술한 경우도 많다. 역사교사들은 복사해 붙인 교과서, 중고등학생의 수준을 고려하지 않은 교과서, 최근 연구 결과가 빠진 교과서라고 당장 폐기를 주장하고 있다.
각종 오류 속에 비선실세에 의한 비선집필진 의혹도 나오고 있다. 국사편찬위원회가 현장검토본 전 자료인 초고본, 개고본 등 기초자료를 파쇄한 비상식적인 일을 벌여서 그 의도가 상당히 의심스럽다. 교육부는 중간본 파쇄가 당연한 일이라고 하지만 이는 있을 수 없는 일이다. 조금이라도 글을 써본 사람이라면 수정 중에도 초고본이 필요할 때가 있어서 쉽게 파쇄하지 않는다. 하물며 그렇게 논란이 된 국정교과서의 기초자료를 무엇이 급하다고 파쇄부터 했는지 의문이다. 게다가 국편이 인쇄본 책자, 집필진과 오고간 이메일 기록 등도 엄격한 보안을 이유로 일괄 파쇄하고 폐기함으로써 논란과 의혹에 더욱 불을 붙인 상황이다.
계속 쏟아지는 오류 지적에 교육부는 의아할 정도로 당당하게 임하고 있다. 그런 오류들을 수정하기 위해 현장검토본을 공개했으며 이를 받아들여 수정하면 된다는 식이다. 또한 논쟁이 되는 부분, 즉 ‘대한민국 정부 수립’과 관련한 사실 등은 토론회를 통해서 논란거리를 해소하겠다고 밝히고 있다. 현대사 부분에 정통 역사학자가 없었다는 것 자체가 논란을 자초한 일이다. 수정에 수정을 거듭하다보면 결국 누더기 교과서가 될 수밖에 없다. 역사교과서의 국정화 자체가 교육의 근본정신에 어긋난 만큼 역사교과서 국정화는 철회되어야 마땅하다.